O curso de Ciências Contábeis do Centro Universitário FMU é oferecido em oito semestres, nas modalidades presencial, semipresencial e a distância. A formação é conduzida por professores mestres e doutores com experiência no mercado, unindo conteúdos teóricos e práticos em conformidade com as normas do Ministério da Educação (MEC) e do Conselho Federal de Contabilidade (CFC).

Entre os diferenciais da FMU estão os programas de extensão, como o Núcleo de Apoio Contábil e Fiscal (NAF), desenvolvido em parceria com a Receita Federal, e o Programa de Apoio Fiscal e Empresarial (PAFE), em colaboração com a Secretaria da Fazenda de São Paulo. O curso também disponibiliza um preparatório para o exame de suficiência do CFC, realizado nos últimos três semestres, além de acesso a laboratórios de informática, certificações intermediárias, imersões em empresas e mentorias voltadas ao desenvolvimento de carreira.

De forma geral, a graduação em Ciências Contábeis capacita profissionais para registrar, analisar e interpretar informações financeiras de empresas e organizações. O contador pode atuar em áreas como contabilidade geral, auditoria, controladoria, perícia contábil, consultoria tributária, contabilidade pública e planejamento financeiro, com oportunidades tanto no setor privado quanto no público. Para exercer a profissão, é necessário obter registro no Conselho Regional de Contabilidade (CRC).

Na FMU, o estudante desenvolve competências técnicas e práticas que incluem a interpretação de demonstrações contábeis, a elaboração de relatórios financeiros e gerenciais, a apuração de tributos e o planejamento tributário. A formação também contempla o domínio de softwares e sistemas de gestão contábil, a aplicação de princípios de ética profissional e o desenvolvimento do raciocínio lógico e do pensamento crítico para a resolução de problemas ligados à área.